Laboratorium Arsitektur Nusantara Jurusan Arsitektur FTUB awalnya merupakan bagian dari laboratorium Teori dan Sejarah Arsitektur yang diketuai oleh Ema Yunita Titisari, ST., MT. Kemudian atas inisiasi dari (Alm.) Dr. Ir. Galih Widjil Pangarsa, DEA., yang merujuk pada visi misi Jurusan Arsitektur yaitu ‘Menjadikan jurusan yang terkemuka di bidang pendidikan, penelitian, dan pengabdian dalam keilmuan arsitektur, serta menghasilkan sarjana yang berbudi luhur, cerdik, cakap dan bermanfaat bagi kehidupan bermasyarakat sesuai dengan pilihan keahlian dalam berkarya lingkup nasional dan internasional’, dengan fokus pengembangan keilmuan arsitektur Nusantara, kemudian lahirlah Laboratorium Arsitektur Nusantara sebagai cermin dari keseriusan Jurusan dalam pengembangan keilmuan arsitektur Nusantara. Melalui Surat Keputusan Rektor Universitas Brawijaya maka terbentuklah Laboratorium Arsitektur Nusantara untuk pertama kalinya pada tahun 2010, dan bersama dengan Laboratorium Sejarah Arsitektur berada di bawah koordinasi KDK (Kelompok Dosen Keahlian) Teori dan Sejarah yang diketuai oleh Noviani Suryasari ST., MT. saat itu.
Pada tahun 2011, seiring dengan dihapusnya sistem Kelompok Dosen Keahlian (KDK), maka Laboratorium Arsitektur Nusantara berdiri sejajar bersama dengan 8 (delapan) laboratorium lainnya di Jurusan Arsitektur FTUB. Pengesahan organisasi Laboratorium didasarkan pada Surat Tugas Dekan Nomor 1907/UN10.6/KP/2011 yang mengesahkan (alm.) Dr. Ir. Galih Widjil Pangarsa sebagai ketua Laboratorium.
Pada tahun 2015, terjadi perampingan tata kelola Jurusan Arsitektur FTUB khususnya laboratorium, maka terjadi peleburan laboratorium yang dianggap memiliki pengembangan keilmuan yang sama. Oleh karena Laboratorium Sejarah Arsitektur dan Laboratorium Arsitektur Nusantara dinilai memiliki visi dan misi untuk pengembangan keilmuan yang sebidang, maka kedua laboratorium ini dilebur menjadi satu, menjadi Laboratorium Arsitektur Nusantara. Pada saat yang bersamaan, terbentuk pula Kelompok Keahlian Jabatan Fungsional (KKJF) sebagai wadah keilmuan dosen sekaligus sebagai regulator manajemen mata kuliah. Sejak bulan Maret 2018 hingga saat ini, Laboratorium Arsitektur Nusantara dikepalai oleh Dr.techn. Ir. Yusfan Adeputera Yusran, ST., MT.Ars, dan Abraham Mohammad Ridjal, ST., MT. sebagai koordinator KKJF Arsitektur Nusantara. Seiring beralihnya status UB menjadi PTNBH, maka saat ini KKJF Arsitektur Nusantara berganti sebutan menjadi Kompartemen Arsitektur Nusantara
